كانت أول عملية تنقيب رسمية في البترا بقيادة عالمي الآثار البريطانيين أجنيس كونواي وجورج هورسفيلد، اللذين شغلا منصب كبير مفتشي الآثار في شرق الأردن بين عامي 1928 و1936. ومنذ رحلتهما الرائدة الى البترا، قامت مجموعات مختلفة من البعثات الأثرية الدولية والمحلية بجهود بحثية مكثفة. ومع ذلك، يُقدر أن حوالي 20% فقط من موقع البترا المترامي الأطراف تم استكشافه أثريًا حتى الآن.
قامت محمية آثار البترا بتقديم المساعدة والتسهيلات لحوالي 22 بهثة تنقيب أثرية أجنبية ومحلية في البترا والبيضة، وشملت الحفريات الأثرية التالية:
مجمع حديقة وبركة البترا
تحت إشراف: البعثة الأمريكية / جامعة بنسلفانيا
بقيادة الدكتورة ليآن بيدال
حفريات جبل هارون
تحت إشراف: البعثة الفنلندية / جامعة هلسنكي
بقيادة الدكتور جاكو فروزن
حفريات قصر البنت
تحت إشراف: البعثة الفرنسية
بقيادة الدكتور كريستيان أوجي والدكتور فرانسوا رينيل
مصلى الملك عبادة
تحت إشراف: البعثة الفرنسية / جامعة كيل
بقيادة الدكتور لورانت تولبك
المعبد الكبير في البترا
تحت إشراف: البعثة الأمريكية / جامعة براون
بقيادة الدكتورة مارثا جوكوسكي
معبد الأسود المجنحة
تحت إشراف: المركز الأمريكي للأبحاث الشرقية (ACOR)
بقيادة الدكتورة ماريا إيلينا رونزا
وادي فرسا
تحت إشراف: البعثة الفرنسية / جامعة مونبلييه
بقيادة الدكتور ستيفان شميت
إشكارت أمسيعيد
تحت إشراف: البعثة الدنماركية / جامعة كوبنهاغن
بقيادة الدكتور إنغولف ثويز
وادي المطاحة
تحت إشراف: البعثة الأمريكية / جامعة بريغهام يونغ
بقيادة الدكتور ديفيد جونسون
الوعيرة / الحبيس
تحت إشراف: البعثة الإيطالية / جامعة فلورنسا
بقيادة الدكتور غيدو فانيتي
قرية بعجة
تحت إشراف: البعثة الألمانية / جامعة برلين
بقيادة الدكتور هانس جيبل
الزنطور
تحت إشراف: البعثة السويسرية / جامعة بازل
بقيادة الدكتور برنهارد كولب
ساحة الخزنة
تحت اشراف: دائرة الآثار العامة
بقيادة الدكتور سليمان الفرجات وسامي النوافلة
سد وادي الجرة
تحت إشراف: جمعية حماية البترا (PNT)
بقيادة الدكتور اولي بلفالد
مشروع مسح شمال شرق البترا
تحت إشراف: الدكتور ستيفان ج. شميت، زبجنيوف ت. فييما وبرنهارد كولب
قرية العصر الحجري الحديث في البيضة
تحت إشراف: مجلس الأبحاث البريطاني في المشرق
بقيادة الدكتور بيل فينلايسون
شمال البترا
تحت إشراف: جامعة شرق كارولينا
بقيادة: الدكتورة ميغان بيري
مسح الدير
تحت إشراف: جامعة بريغهام يونغ
بقيادة: الدكتورة سينثيا فينلايسون